V Evropski uniji kmetijstvo danes predstavlja najpomembnejši vir pritiska na naravne ekosisteme. Kaže se slabšanje stanja narave tako na območjih Natura 2000 kot izven njih. V Sloveniji je stanje ohranjenosti za številne habitatne tipe (travišča in barja) ocenjeno kot neugodno, negativne trende pa beležimo tudi pri različnih vrstah rastlin in živali, tako na nivoju njihove razširjenosti kot tudi številčnosti populacij. Ti trendi so posledica velikih sprememb v načinu kmetijske rabe in razvoju podeželskih območij v zadnjem stoletju.